Возможно ли сделать
Конечно возможно. Как возможно все, что не противоречит законам природы.
Однако по существу.
1. Вы взяли в качестве драйвера
IR2113. Он вообще то создан для бутстрепных топологий. То есть для формирования сигналов в вертикальную стойку - полумост. А у вас трансформаторный пуш-пул и для него нужен драйвер нижнего плеча. Например
IR4427.
2. Проблема всех трансформаторных пуш-пулов состоит в том, что потенциальное (непосредственно от генератора, хоть и через драйвер) управление создает риски короткого замыкания ключа через обмотку трансформатора при останове генератора. Один из ключей окажется открытым.
Поэтому чаще всего такой каскад раскачивают тоже через трансформатор с тремя обмотками. Одна входная и две выходных. Ну или делают схему защиты от останова генерации, которая запирает оба ключа.
3. Изменение скважности однотактного генератора потребует сначала поделить частоту на 2 и полученным сигналом коммутировать выход генератора между двумя входами. По другому никак. То есть исходная частота должна быть удвоена.
Так же работают таймеры в МК формирующие пуш-пульный сигнал, в отличии от комплементарного сигнала для управления вертикальной стойкой. Они дважды проходят период таймера, формируя в каждом из проходов один импульс на один из выходов, в следующем проходе - на другой.